Las Areas Protegidas en el Ecuador ocupan el 17% del territorio nacional (aprox. 46.000 km2), las más importantes son las Islas Galápagos y el Parque Nacional Sangay, declarados Patrimonio Natural de la Humanidad por la UNESCO

Parque Nacional Yasuní, localizado en la provincia del Napo, su flora y fauna endémica han sido preservadas desde el Pleistoceno (20.000 a.C), más de 700 especies vegetales han sido identificadas, además de 500 especies de aves y 200 animales diferentes.
La exuberante flora y fauna de la jungla puede ser observada en este parque nacional.

Parque Nacional Llanganates, la mayor parte del parque está cubierta de exuberante vegetación, y el clima es mayormente frío y lluvioso. Cerro Hermoso (4760 m.s.n.m) es la montaña más alta del área, animales comunes de la reserva son el conejo de páramo, el sacha conejo, y la comadreja. Especies hermosas pero difíciles de observar son el oso de anteojos, el venado de cola blanca, venado de páramo, lobo de páramo, puma, tapir, gallo andino, y cóndor. De acuerdo a la leyenda el famoso tesoro de Atahualpa está escondido en los Llanganates.

Parque Nacional Sumaco-Napo-Galeras, posee una gran riqueza y diversidad en lo que a ecosistemas se refiere, que va desde montañas hasta selvas húmedas y nubladas. Incluye alturas desde 600 hasta 3900 m.s.n.m. El volcán Sumaco (3900m.), rodeado por selva montano baja, se encuentra aislado del el resto de los Andes. Es muy rico en especies de selva húmeda tropical y bosque nublado: oso de anteojos, algunos tipos de murciélago, marsupiales, armadillos, águilas, guams, gallo andino, y muchas especies de reptiles y anfibios.

Parque Nacional Podocarpus, localizado en las provincias: Loja y Zamora Chinchipe Este parque tiene dos zonas: jungla y tierra montañosa, con una gran diversidad en vegetación y especies de aves, se encuentra las más exóticas orquídeas, osos, pumas, aves cantoras, tucanes, reptiles y pájaros carpinteros. Es el lugar ideal para llevar a cabo investigaciones de tipo botánico, ecológico y zoológico.

Parque Nacional Sangay, ubicado en tres provincias del Ecuador: Tungurahua, Chimborazo y Morona Santiago. En el se elevan tres montañas importantes: Sangay (5228m), Altar (5317m), y el Tungurahua (5014m). Estas montañas ofrecen la posibilidad de hacer caminata, expedición y escalada, el Sangay está en constante erupción y su ascención es una aventura ariesgada.

Parque Nacional Cotopaxi, se ubica en la provincia de Cotopaxi en la sierra ecuatoriana, a 60 km al sur de Quito. El volcán Cotopaxi , 5897m.s.n.m., atrae a escaladores de todo el mundo. El parque es el hogar de pumas, ciervos, cóndores, caballos salvajes y llamas.
La laguna de Limpiopungo cerca del volcán Rumiñahui (4721m) es otro atractivo que vale la pena visitar. Las Ruinas de Pucará eran fortalezas prehispánicas de los Incas
Parque Nacional Cajas, está a 33 km de la ciudad de Cuenca. La altitud en el parque oscila entre 3000 y 3500m, incluye montañas y un complejo lacustre de 232 lagunas de origen glaciar, conectadas unas con otras con riachuelos y arroyos. Dos de los ríos que llegan a Cuenca, el Tomebamba y el Yanuncay, nacen en este parque. El Cajas tiene variedad de mamíferos tales como el venado de cola blanca, oso de anteojos, puma, venado de páramo, conejo de páramo y el tapir andino. Las especies de aves más importantes son el Caracara, el Cóndor y el Tucán andino. La vegetación más común incluye a la Chuquiragua, Pajas de páramo, yagual (Polylepis), romerillo, chachacoma, genciana, romerillo y el sarar.

Parque Nacional Machalilla, ubicado en la provincia de Manabí, incluye hermosos escenarios de bahías, acantilados, kilómetros de playa, y selvas. Tiene sitios maravillosos: Isla de la Plata frente a las costas de Puerto López, Playa de Los Frailes, sitio arqueológico de Agua Blanca, Salango, y las playas de Puerto Rico y Puerto Cayo. La Isla de La Plata ofrece la posibilidad de observar piqueros de patas azules (que solo encontramos en las Galápagos), fragatas, y la asombrosa vida marina. En los meses de Junio a Septiembre se presenta un "atractivo" especial cuando las ballenas jorobadas vienen a aparearse en la zona de Puerto López.

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